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按卫生部近年颁布的《临床住院医师规范化培训试行办法》，培训分二个阶段。2009年发布的《住院医师规范化培训标准（试行）》明确说明规范化培训时间一般为3年。
第一阶段：三年，在二级学科范围内，轮转参加本学科各主要科室的临床医疗工作，进行全面系统的临床工作基本训练。
第二阶段：两年，进一步完成轮转，逐步以三级学科为主进行专业训练，深入学习和掌握本专业的临床技能和理论知识，最后一年应安排一定时间担任总住院或相应的医院管理工作。
基本做法：
1.以临床实践、专业必修课、公共必修课专业课为培训的主要内容，要求住院医师在二个阶段分别通过考试取得相应课程学分。
2．培训的方法：临床实践以在岗培训为主，由科室集体指导。外语及专业必修课主要通过自学完成，部分公共必修课和选修课则通过业余办班面授完成，也可通过自学、参加该课水平测试获得学分。
3.对工作满5年，学分符合要求者，经临床能力考核合格，发给住院医师培训合格证书，作为申报中级专业技术职务任职资格的必备条件。为部分在职临床医师申请临床医学专业学位所需，对从事临床工作3年以上，完成住院医师第一阶段规范培训并通过考核者，可发给《住院医师规范化培训合格证书》。
在实施住院医师规范化培训中，应根据“知识宽、基本厚”的要求，注重医德培养，强调三基训练，先宽后专，循序渐进，加强临床实践，以理论联系实际为原则。制度中注意：①培训——考核——晋升相结合，以利于调动培训的积极性；②实行以实践为主、技能为主，自学为主，业余为主的在岗培训，以利于改变轻实践的倾向；③知识结构力求合理，注重医疗、医学科研相结合，以打好扎实的基础。
考核评估
住院医师培训的考核必须规范，并逐渐达到标准化的要求。考核分平时考评和阶段考试、各医院自行组织考核和省、市高等学校统一组织的理论考试、计算机考试等不同方式，其考核内容和程序如图3所示。
科室考评
每一科室轮转结束，由科主任组织考评小组人员，以无记名投票方法对住院医师的医德医风、临床技能、教学能力作出综合评价，记入轮转手册。医德医风的内容包括：①对工作的责任心、服务态度，遵纪守法、劳动纪律的评定；②医疗作风的评定；③有否差错、事故；④团结互助、顾大局、识大体的表现。评为优或良者为合格，如医德医风不合格者，则该年该轮转中临床实践均不记学分。对临床技能如病史采集能力、全面体检能力、操作及手术技能，采取面对面考核的办法，并须达到规定的学分。
外文水平
选用英文版克氏外科学和希氏内科学内容。水平测试每年举行一次，住院医师进入第二阶段起均可参加外文水平测试，形式为英译中，要求达到2小时完成4000印刷符号的翻译量。
专业理论
即将结束第二阶段培训的住院医师必须参加统一组织的专业理论考试。以达到各专业低年资主治医师的基本要求。
临床能力
包括专业技术及临床决策能力两方面，前者由专家对住院医师的病史采集、体检能力、医疗操作技能、手术操作技能等进行面对面考核；而后者则分别在第一阶段与第一阶段培训结束时进行。可采用面对面病例分析的考试方法，也可使用计算机辅助考试系统进行测试，使临床决策能力测试向更加科学的方向发展。为了在培训中加强和巩固住院医师的问诊和体检的临床技能，还可引入标准化病人的考核方式。
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